Estudios de asociación de todo el genoma con el prolapso de la glándula del tercer párpado en perros

Estudios de asociación de todo el genoma con el prolapso de la glándula del tercer párpado en perros

Estudios de asociación de todo el genoma con el prolapso de la glándula del tercer párpado en perros

\r\nYu Zeng,,&#x;Yu Zeng1,2,3Cundong Feng&#x;Cundong Feng4Zheli Jiang,,Zheli Jiang1,2,3Weian DuWeian Du5Shan He,,Shan He1,2,3Xingnuan Li,,Xingnuan Li1,2,3Yi Fan,,Yi Fan1,2,3Xiao Ouyang,,Xiao Ouyang1,2,3Bixin Huang,,Bixin Huang1,2,3Yan Su,,Yan Su1,2,3Siyu Wang,,Siyu Wang1,2,3Rongxing WeiRongxing Wei6Zonghao DaiZonghao Dai6Peng JinPeng Jin6Jianyun Liu,,Jianyun Liu1,2,3Qianyong Yang,,
Qianyong Yang1,2,3*
  • 1Laboratorio Clave de Investigación de Enfermedades Raras de Jiujiang, Universidad de Jiujiang, Jiujiang, China
  • número arábigoLaboratorio Clave Provincial de Jiangxi de Terapia de Precisión Celular, Escuela de Ciencias Médicas Básicas, Universidad de Jiujiang, Jiujiang, China
  • 3Centro de Innovación de Tecnología y Aplicación de Biosensores de Jiujiang, Universidad de Jiujiang, Jiujiang, China
  • 4Escuela de Agricultura y Silvicultura Tropical (Escuela de Agricultura y Asuntos Rurales, Escuela de Revitalización Rural), Universidad de Hainan, Haikou, China
  • 5Facultad de Estomatología y Medicina, Universidad de Foshan, Foshan, China
  • 6Base de perros policía de Nanchang del Ministerio de Seguridad Pública de China, Nanchang, China

El ojo de cereza, el nombre común para el prolapso de la tercera glándula palpebral en los perros, es una enfermedad oftálmica generalizada que afecta a perros de diversas razas. Esta afección afecta gravemente a la calidad de vida de los perros afectados, y su causa subyacente sigue sin resolverse. En este estudio, se recopilaron 170K datos de microarrays SNP de 653 perros braquicéfalos y 788 perros braquicéfalos y mesocéfalos. Estos dos conjuntos de datos se analizaron por separado en estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) con 12 razas de perros afectadas por el ojo de cereza. El análisis GWAS de 653 perros de cabeza corta reveló que cuatro SNPs en la región CFA3:15627075-15983629 pb superaban el umbral de significación a nivel del genoma. El análisis de asociación de esta región también indicó que estos cuatro SNPs estaban fuertemente asociados. La anotación genética mostró que la región contenía genes como KIAA0825, FAM172A y NR2F1, de los cuales NR2F1 estaba asociado con el desarrollo del ojo. Los resultados mostraron que el análisis GWAS realizado en 788 perros de cabeza corta y mediana identificó cinco SNPs en la región CFA22:15627075-15983629 pb que superaban el umbral de significación a nivel del genoma, y se realizó un análisis de asociación en esta región, que mostró que estos cinco SNPs estaban fuertemente asociados. Además, se identificaron 104 genes anotados en ambos GWAS. Para explorar los genes implicados en los ojos de cereza, realizamos un análisis de enriquecimiento funcional GO. Los genes implicados en la vía alta fueron DIO3 y TTC8. Además, un análisis en profundidad reveló 33 genes asociados con el desarrollo ocular y las enfermedades. Nuestro estudio proporciona nuevas perspectivas para una mayor comprensión del ojo de cereza en perros.

 

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