Hui Sheng^1†Junxing Zhang^2†Xiaodi Shi¹Long Zhang^1,2Dawei Yao¹Peipei Zhang¹Yupeng Li¹Jinlong Zhang¹Xiaofei Guo^1*Xiaosheng Zhang^1*

• ¹Laboratorio Clave de Tianjin de Cría Molecular Animal y Biotecnología, Centro de Investigación de Ingeniería de Tianjin de Agricultura Animal Saludable, Instituto de Ciencia Animal y Veterinaria, Academia de Ciencias Agrícolas de Tianjin, Tianjin, China
• ^{número arábigo}Facultad de Ciencia Animal y Medicina Veterinaria, Universidad Agrícola de Tianjin, Tianjin, China

Fondo: La enfermedad respiratoria bovina (ERB) es una afección prevalente y costosa en la industria ganadera, que afecta la productividad a largo plazo, el uso de antibióticos y la inocuidad alimentaria mundial. Por lo tanto, la identificación de biomarcadores fiables para la BRD es crucial para el diagnóstico precoz, el tratamiento eficaz y el seguimiento de los resultados terapéuticos.

Métodos: Este estudio identificó genes expresados diferencialmente (DEG) asociados con BRD mediante el análisis de un conjunto de datos de expresión de secuenciación de ARN en sangre asociados con BRD, y realizó un análisis de anotación de ontología génica (GO) y un enfoque de enriquecimiento de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto (KEGG) en estos DEG. Mientras tanto, los módulos clave relacionados con BRD se examinaron mediante análisis de redes de coexpresión génica ponderada (WGCNA), y los genes del módulo se cruzaron con DEGs. Posteriormente, se emplearon el operador de selección y contracción mínima absoluta (LASSO) y el análisis de bosque aleatorio (RF) para identificar posibles biomarcadores. Finalmente, se realizó un análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA) para explorar los posibles mecanismos de los biomarcadores identificados, y su importancia diagnóstica se evaluó mediante el análisis de la curva de características del operador del receptor (ROC) y la PCR cuantitativa fluorescente en tiempo real (RT-qPCR). Además, se evaluó la infiltración de células inmunitarias en BRD mediante el algoritmo CIBERSORT y se analizó la correlación entre biomarcadores e infiltración de células inmunitarias.