Juliana Menezes^1,2Manuel Rodrigues¹Tiago Pinto-Lima^1,3,4Sara Isidoro¹André Meneses^1,2,5,6Adriana Belas^1,2,5,6*

• ¹Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Lusófona – Centro Universitario de Lisboa, Lisboa, Portugal
• ²I-MVET – Investigación en Medicina Veterinaria, Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Lusófona – Centro Universitario de Lisboa, Lisboa, Portugal
• ³Departamento de Inmunofisiología y Farmacología – Instituto de Ciencias Biomédicas Abel Salazar (ICBAS), UP, Oporto, Portugal
• ⁴LAQV@REQUIMTE, Universidad de Oporto (UP), Oporto, Portugal
• ⁵IPLUSO – Escuela Superior de Salud, Protección y Bienestar Animal, Instituto Politécnico de Lusofonia, Lisboa, Portugal
• ⁶CECAV – Centro de Investigación Animal y Veterinaria, Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad de Lusófona – Centro Universitario de Lisboa, Lisboa, Portugal

Los estafilococos son patógenos oportunistas importantes de animales de compañía y un importante reservorio de genes de resistencia antimicrobiana con relevancia zoonótica. La otitis externa es una de las afecciones más comunes que requieren terapia antimicrobiana en la práctica veterinaria, aunque los datos que integran análisis fenotípicos y genómicos de aislados estafilocócicos siguen siendo limitados. Este estudio retrospectivo tuvo como objetivo caracterizar los aislados de Staphylococcus recuperados de casos de otitis externa en perros y gatos. Las cepas de Staphylococcus spp. (n = 76) recuperadas de casos de otitis en perros y gatos, identificadas mediante secuenciación del gen 16S rRNA, fueron analizadas para detectar susceptibilidad a antimicrobianos según las directrices CLSI. Las cepas resistentes a la meticilina (n = 11) se caracterizaron además mediante secuenciación del genoma completo (WGS) para determinar tipos de secuencia, determinantes de resistencia y genes asociados a la virulencia. Staphylococcus pseudintermedius fue la especie predominante identificada. Una alta proporción de cepas mostró resistencia a tetraciclinas y lactámicas β, y el 39,5% se clasificó como multirresistente (MDR). Las cepas resistentes a la meticilina portaban mecA y pertenecían predominantemente a la línea europea resistente a la meticilina S. pseudintermedius (MRSP) ST551, junto con ST496, ST1786, ST1095 y tres tipos de secuencia novedosos. El análisis genómico reveló un repertorio conservado de virulencia que incluye leucocidinas, genes asociados a biopelículas (icaBDCA, sdrD), enzimas de maduración de lipoproteínas (lgt, lspA) y exotoxinas inmunomoduladoras. El análisis basado en SNPs principales mostró que dos cepas de perros originarios de dueños diferentes diferían solo en dos SNPs. La combinación de resistencia fenotípica y determinantes de virulencia genómica observada en estas cepas resalta la importancia clínica de Staphylococcus spp. en otitis externa y refuerza la necesidad de una gestión antimicrobiana prudente y de medidas robustas de control de infecciones en medicina veterinaria. El estudio también ilustra cómo la vigilancia genómica sostenida puede generar conocimientos que apoyan tanto acciones veterinarias como de salud pública.