Resumen

Las enfermedades respiratorias y entéricas son factores principales que contribuyen a la morbilidad, mortalidad y pérdida económica en la producción bovina, con importantes implicaciones para el bienestar animal, especialmente en los terneros. Los enfoques diagnósticos tradicionales han sentado las bases para la detección de patógenos en el ganado, proporcionando herramientas esenciales para la vigilancia y control de enfermedades. Sin embargo, su naturaleza dirigida limita la capacidad de identificar infecciones inesperadas, novedosas o polimicrobianas que a menudo subyacen a los síndromes respiratorios y entéricos complejos. Los avances recientes en tecnologías moleculares, en particular la secuenciación de amplicones (metataxonómica), metagenómica y metatranscriptómica, permiten un perfilado no dirigido y de alta resolución de comunidades microbianas directamente a partir de muestras clínicas, ofreciendo un potencial transformador para la investigación y el diagnóstico. Esta revisión sintetiza las aplicaciones actuales de estos enfoques en la investigación de enfermedades respiratorias y entéricas bovinas, destacando hallazgos clave en virología, bacteriología y parasitología. En conjunto, estos estudios han ampliado el catálogo de la diversidad microbiana, pero su interpretación sigue siendo cuestionada por la comprensión aún en evolución de las contribuciones microbianas a la patogénesis. El progreso hacia la integración clínica se ve aún más obstaculizado por la necesidad de estandarización metodológica, validación y mejores marcos interpretativos. De cara al futuro, avanzar en estas tecnologías requerirá protocolos armonizados, integración de conjuntos de datos multi-ómicos y estudios experimentales y epidemiológicos sólidos para establecer vínculos causales entre las firmas microbianas y los resultados de enfermedades. Al unir el descubrimiento y la aplicación, estos enfoques tienen el potencial de mejorar la precisión diagnóstica, reforzar la vigilancia y apoyar sistemas sostenibles de producción ganadera. A medida que estas tecnologías continúan evolucionando, es probable que desempeñen un papel cada vez más central en la investigación y el diagnóstico de enfermedades bovina.