Diferencias entre los perfiles de suero, plasma y metabolitos urinarios caninos de muestras recogidas al mismo tiempo

Diferencias entre los perfiles de suero, plasma y metabolitos urinarios caninos de muestras recogidas al mismo tiempoDiferencias entre los perfiles de suero, plasma y metabolitos urinarios caninos de muestras recogidas al mismo tiempo

  • Robin Moore 1*

  • Johanna Anturaniemi 1

  • Vidya Velagapudi 2

  • Anna Hielm-Björkman 1
  • 1. Department of Equine and Small Animal Medicine, Faculty of Veterinary Medicine, University of Helsinki, Helsinki, Finland

  • 2. Metabolomics Unit, Institute for Molecular Medicine Finland FIMM, University of Helsinki, Helsinki, Finland

Resumen

Antecedentes: 

La elección de la biomuestra puede influir sustancialmente en las mediciones de metabolitos, pero las comparaciones coincidentes de suero, plasma EDTA, plasma de litio-heparina y orina siguen siendo limitadas en metabolómicas dirigidas a canos.

Objetivos: 

Evaluar la comparabilidad cruzada de los perfiles de pequeños metabolitos polares objetivo en perros y valorar cómo diferentes biomuestras capturan la variación asociada a la dieta y la salud.

Animales: 

Perros propiedad de clientes de un ensayo de alimentación previamente reportado.

Métodos: 

Resultados:

Conclusiones e importancia clínica:

La elección de la biomuestra afecta de forma significativa al perfilado de metabolitos dirigidos en perros. El plasma sérico y el plasma de heparina de litio eran globalmente más similares entre sí que ambos con el plasma EDTA, mientras que la orina era una matriz complementaria distinta en lugar de un sustituto sanguíneo. El suero fue la matriz más robusta para detectar variaciones asociadas a la dieta.

Se realizó cromatografía líquida de ultra-rendimiento dirigida y espectrometría de masas tándem (UPLC-MS/MS) en biomuestras emparejadas de una cohorte basal de matriz sanguínea (suero, plasma EDTA, plasma de litio-heparina) y una cohorte suero-orina al final del ensayo. Se excluyeron los metabolitos con >20% de valores faltantes dentro de una matriz y las muestras con >20% de valores metabolitos faltantes dentro de un biofluido. Se evaluó la concordancia entre matrices usando la correlación de Pearson y las diferencias de concentración medias por pareslogar 10. Se utilizaron PCA y PERMANOVA para comparar los efectos globales de la matriz y la separación asociada a la dieta y la salud.

 

Trabajo completo aquí  

 

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