Xinwei Tan^1†Xiaoyu Zheng^1,2†Guangyuan Zou^1,3Manxin Ma^1,2Ze Yuan^1,3Gong Lang^1,2Guihong Zhang^1,2,3*

• ¹Laboratorio Clave Provincial de Guangdong para la Prevención y Control de la Zoonosis, Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Agrícola del Sur de China, Guangzhou, China
• ²Laboratorio Clave de Desarrollo de Vacunas Animales, Ministerio de Agricultura y Asuntos Rurales, Guangzhou, China
• ³Centro de la Sucursal Zhaoqing del Laboratorio de Guangdong para la Ciencia y Tecnología Agrícola Moderna de Lingnan, Zhaoqing, China

Los brotes de diarrea en cerdos ocurren con mayor frecuencia durante el invierno; el rotavirus porcino (PoRV) es una de las enfermedades diarreicas más importantes. La reacción en cadena de la polimerasa digital de gotas (DDPCR), un método de detección que puede realizar la cuantificación absoluta de genes. El estudio tenía como objetivo diagnosticar la infección por PoRV utilizando un DDPCR basado en sonda. Se obtuvieron 10 lechones de dos días con diarrea leve en una granja porcina comercial. No se detectó PoRV en el hisopo anal con tiras reactivas de oro coloidal. Para verificar los resultados de las tiras de prueba de oro coloidal, se realizó RT-qPCR, que identificó PoRV en seis lechones. Dada la sensibilidad limitada de las tiras reactivas de oro coloidal y la RT-qPCR, desarrollamos un ensayo DDPCR dirigido al gen PoRV Vp4 para mejorar su detección. El ensayo DDPCR demostró un rendimiento óptimo con una concentración cebador:sonda de 400:400 nM y una temperatura de recocido de 57 °C. Alcanzó un límite mínimo de detección de 0,21 copias/μL, y la sensibilidad de detección se ha incrementado 100 veces en comparación con la RT-qPCR. Utilizando el método establecido de detección DDPCR, las cuatro muestras que dieron negativo por RT-qPCR fueron vueltas a analizar, y todas resultaron ser positivas para PoRV, lo que indica que la sensibilidad de DDPCR era mayor que la de RT-qPCR. Este estudio destaca su potencial como una herramienta valiosa para el diagnóstico clínico temprano y el control de enfermedades en lechones.