Fragmentos de huéspedes similares en el genoma del virus de la peste porcina africana: distribución, funciones y evolución

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Abstracto

El virus de la peste porcina africana (PPA) infecta predominantemente a Argasidae y suidos, lo que provoca una elevada morbilidad y mortalidad en los cerdos. A pesar del papel crucial que desempeñan las secuencias virales similares a las del huésped en la supervivencia del virus, existen estudios exhaustivos limitados sobre las similitudes genómicas entre el virus de la PPA y sus huéspedes. En consecuencia, este estudio emplea el análisis de homología para construir una red de similitud entre el virus de la peste porcina africana y sus huéspedes (Argasidae y suidos), investigando la distribución, función, evolución y orígenes de estas secuencias similares en el virus de la peste porcina. Nuestros hallazgos indican que los fragmentos similares al huésped se distribuyen principalmente entre las posiciones 70000 y 180000 del genoma del virus de la PPA, principalmente dentro de las regiones no codificantes. En particular, estos fragmentos no codificantes a menudo se asocian con funciones promotoras. Además, el análisis de las proteínas suid que comparten similitudes con las proteínas del virus de la PPA revela que presentan predominantemente actividad de ARN polimerasa y están implicadas en procesos metabólicos. El análisis evolutivo indica que existen secuencias pansimilares de PPA en estado abierto, lo que pone de manifiesto la diversidad de estas secuencias análogas. Además, se identificó una correlación positiva entre la ocurrencia de puntos de ruptura de recombinación y secuencias similares, lo que indica que la recombinación homóloga puede servir como un mecanismo crucial que impulsa la formación de estas secuencias análogas.

 

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