Aislamiento y caracterización del genoma completo de un rotavirus porcino emergente G9P[23] en el centro de China

Aislamiento y caracterización del genoma completo de un rotavirus porcino emergente G9P[23] en el centro de ChinaAislamiento y caracterización del genoma completo de un rotavirus porcino emergente G9P[23] en el centro de China

Chaoliang Leng
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  • 1Centro Provincial de Ingeniería y Tecnología de Diagnóstico e Control Integrado de Enfermedades Animales, Laboratorio Clave de Biología de Insectos de Henan, Centro de Investigación de Ingeniería de Biorreactores de Insectos de la Provincia de Henan, Laboratorio Conjunto Internacional China-Reino Unido de Biología de Insectos de la Provincia de Henan, Universidad Normal de Nanyang, Nanyang, China
  • 2Laboratorio Estatal Clave para el Control y la Prevención de Enfermedades Animales, Instituto de Investigación Veterinaria de Harbin, Academia China de Ciencias Agrícolas, Harbin, China

El rotavirus (VD), un patógeno entérico importante, causa enfermedad diarreica tanto en lechones lactantes como en bebés. Para caracterizar las características genómicas y los patrones evolutivos de una cepa de rotavirus porcino (PoRV), aislamos cepas virales de muestras de lechones diarreicos confirmados por RT-qPCR mediante inoculación con cultivo celular MA104. Los aislados virales se caracterizaron de forma definitiva mediante amplificación RT-PCR, ensayo indirecto de inmunofluorescencia (IFA) y microscopía electrónica de transmisión (TEM), seguidos de una secuenciación integral del genoma y un análisis filogenético. Los resultados demostraron el aislamiento exitoso de un genotipo G9P[23] PoRV, designado HN240916. El análisis del genoma completo reveló que la constelación de genotipos era G9-P[23]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1. El análisis genómico reveló que los genes NSP3 y NSP5 de la cepa HN240916 se agrupan monofiléticamente con los RVs humanos, mientras que todos los genes restantes muestran una afinidad filogenética cercana a las líneas de PoRV. La constelación de genotipos proporciona evidencia genómica de un evento pasado de reagrupamiento interespecies entre vehículos recreativos porcinos y humanos. Este estudio amplía los recursos de epidemiología molecular de PoRV y permite estrategias de prevención basadas en genotipos.

 

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